Phân hữu cơ là phân chứa những chất dinh dưỡng ở dạng những hợp chất hữu cơ như: phân chuồng, phân xanh, phân than bùn, phụ phế phẩm nông nghiệp, phân rác…
Mặc dù các chất hữu cơ chỉ chiếm 2 - 5 % tổng khối lượng của đất nhưng rất quan trọng đối với thực vật và hệ sinh vật đất nói chung, chúng tham gia vào rất nhiều các quá trình hoá học và hoá sinh học trong môi trường đất.